软件与微电子学院前身是软件学院，成立于 2003年4月，是黑龙江省首批两所省级示范性软件学院之一和全省高校三所试点学院之一。建院以来，以“面向行业、校企协同、机制创新、突出特色、提高质量”为办学指导思想，不断深化改革，人才培养质量持续提升。2005年软件学院被黑龙江省教育厅确定为振兴东北老工业基地计算机软件人才培训中心。2008年学院分别被黑龙江省信息产业厅和哈尔滨市信息产业局确定为首批省级和市级服务外包人才培养培训基地。2009年学院被黑龙江省教育厅确定为黑龙江省人才培养模式创新实验区。同年以软件学院为主要参加单位的“面向东北老工业基地‘定制式’人才培养模式的探索与实践” 项目获国家级教育成果二等奖。2012年学院获第一届黑龙江省普通高校教学管理质量奖。2014年学院荣获黑龙江省 “三育人”先进集体称号。 目前以新技术、新业态、新产业、新模式为特点的新经济和新产业蓬勃发展，迫切需要大批新兴工程科技人才，全世界高等工程教育面临新机遇、新挑战。2017年教育部组织高校共同研讨工程教育发展战略，形成了新工科建设的“三步曲”，即“复旦共识”、“天大行动”和“北京指南”。学校为了实施新工科建设，对学科专业进行优化调整，把微电子科学与工程、电子科学与技术和物联网工程三个专业调整到软件学院，其中微电子科学与工程专业和原软件学院的集成电路设计与集成系统专业合并为集成电路设计与集成系统专业，更名为软件与微电子学院，并被学校确定为哈尔滨理工大学“新工科”试点学院，作为“新工科”建设的示范区，为学院又一次带来了重大发展机遇。 目前软件与微电子学院拥有软件工程和电子科学与技术两个一级学科硕士学位授权点，一个集成电路工程专业硕士学位授权点；设有软件工程、集成电路设计与集成系统、电子科学与技术和物联网工程四个本科专业，其中软件工程专业和电子科学与技术专业为黑龙江省重点专业和卓越工程师教育试点专业。